海藻酸鈉的化學結構中雖然含有羧基，但均為次羧基，對染料的結合能力很低。另外的，海藻酸鈉是陰離子性的，對呈陽離子性的活性染料有排斥作用。所以使用海藻酸鈉作活性染料印花的糊料，它與活性染料基本沒有鍵合的可能，是活性染料較合適的糊料。

但是要注意海藻酸鈉與硬水中的鈣離子能產生沉淀，降低本身的流動性。含有海藻酸鈉的糊料，能在中性和弱堿性條件下和活性染料反應，生成不溶性物質。加入六偏磷酸鈉、偏磷酸鈉等絡合劑，可以防止這種現象發生。